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文献速递|Zenix-C 色谱柱助力探究GPI分子机制

发布时间:2024-03-28浏览次数: 赛分新闻

  引言

  糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定蛋白参与较多生物学过程,如膜相关酶活性、细胞信号转导、细胞粘附和抗原呈递等。GPI锚定蛋白生物合成过程的异常通常引发多种疾病,如阵发性夜间血红蛋白尿、智力障碍和癫痫发作等。

  2024年1月,中科院分子细胞科学卓越创新中心(上海生化细胞所)与复旦大学生物医学研究院/附属口腔医院屈前辉课题组在《Nature Communications》发表了Molecular basis of the inositol deacylase PGAP1 involved in quality control of GPI-AP biogenesis的研究论文(点击文末阅读原文查询文章)。文中利用高效液相色谱(HPLC)系统结合耐热绿色荧光蛋白(TGP)表达,设计了一种基于荧光检测体积排阻色谱(FSEC)的耦合分析方法。这种方法使用赛分科技产品Zenix-C SEC-300体积排阻色谱柱,实现了脂质重塑酶PGAP1底物(TGP3)和最终产物(TGP0)的分离,具有高灵敏度、可重复性和便利性。

背景介绍

  在哺乳动物细胞中,糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白(GPI-APs)在细胞信号转导、细胞黏附、催化等方面发挥重要作用,其合成缺陷导致严重的先天性神经发育紊乱。GPI-APs途径包括合成与重塑两个阶段,涉及20多步膜内催化反应。因此,需要阐明这一重要的翻译后修饰生物发生过程的分子机制,以助力其特异性靶向药物研发。

  目前,对含有GPI的底物/产物的分析主要依赖于半定量方法,如薄层色谱或SDS-PAGE。但由于GPI-APs脂肪酶成分复杂,该方法有一定局限性。因此研究团队设计了一种基于荧光检测体积排阻色谱(FSEC)的耦合分析方法,可以实现PGAP1底物和最终产物的分离。

文章概述

  GPI-APs的分泌和质量控制需要由进化上保守的PGAP1启动的附着后重塑。研究团队设计了一种基于荧光的新型、简便、灵敏的生化分析方法,对其酶学性质进行了表征,并采用哺乳细胞与酵母细胞水平的活性体系对其功能进行了鉴定。继而通过细胞工程方法,捕捉PGAP1与GPI锚定蛋白的复合物,并采用冷冻电镜手段,分析了三个PGAP1在脂环境及与产物复合物的高分辨率结构(2.66−2.84Å),解析了其10-跨膜结构和产物-酶相互作用的机理,揭示了PGAP1介导GPI-AP脂质重塑过程的分子机制,对于进一步深入理解减数分裂重组形成过程有着十分重要的意义。

  文章选用赛分科技Zenix-C SEC-300体积排阻色谱柱,利用SEC-HPLC系统与TGP荧光相结合的方式,实现了PGAP1底物和最终产物的分离,在GPI研究领域潜力巨大。

产物检测

  将混合物在4°C下以21,000g离心10分钟,然后采用Zenix-C SEC-300(3μm,300Å)色谱柱进行上样。在482/508nm波长进行荧光检测体积排阻色谱(FSEC)的监测。TGP0(产物)可以通过使用已知量的TGP0获得校准的FSEC峰强度来量化。

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图1.不同条件处理TGP的FSEC结果

  图1显示了cPGAP1、PI-PLC、PI-PLC分别加20、50 ng的cPGAP1以及不加酶处理TGP3的FSEC结果,结果显示,Zenix-C SEC-300体积排阻色谱柱能够从游离TGP中分离出来自偶联反应的产物(TGP0),该产物以cPGAP1-、PI-PLC-和剂量依赖的方式出现。

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图2.是否采用PI-PLC处理各冷冻电镜样品的FSEC曲线对比

  图2是PI-PLC对不同冷冻电镜样品影响的图谱(单次实验)。FSEC分析显示,样品中有很大一部分TGP3被水解成TGP2,TGP2通过过量的PI-PLC转化为TGP0。TGP2和TGP3(~30kDa)都携带酰基链,因此可以形成detergent mcelles形式(~70kDa),减少了在Zenix-C SEC-300体积排阻色谱柱中的保留时间,从而实现PGAP1底物(TGP3)和最终产物(TGP0)的分离。

实验结论

  该研究设计了一种基于荧光检测体积排阻色谱(FSEC)的耦合分析方法,采用Zenix-C SEC-300体积排阻色谱柱实现了PGAP1底物(TGP3)和最终产物(TGP0)的分离,可以满足实验要求,助力GPI相关分子机制的探究。

产品介绍

  赛分科技SEC系列色谱柱,采用特有的表面修饰技术,分离速度快,分辨率高,通用性好,批次重现性强,适用于质控QC放行,也是分析型SEC值得信赖的产品。

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图3.赛分科技SEC固定相表面修饰工艺

  “-C”系列产品,采用赛分科技独有的固定相修饰工艺,硅胶表面键合一层“平躺”的单分子层,最大程度减少非特异性相互作用。适用于疏水性较强的样品,可以减少有机相的使用,“-C”系列产品安全、环保,让您的实验无后顾之忧。

  赛分科技SEC系列色谱柱,分离范围广,适用于多种细分领域,下表是部分产品的分离范围。

表1.赛分科技SEC色谱柱分离范围

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